A játék körökből áll,melyek 6 fázisra osztható:Draw phase,Standby phase,Main phase 1,Battle phase,Main phase 2 és End phase.

A játék úgy kezdődik,hogy mindenki húz öt lapot,majd eldöntik,ki kezd.Ezután jön a Draw phase(ezzel kezdődik a játékos köre).Húznia kell egy lapot,majd következik a Standby phase(vannak olyan varázskártyák,amelyeket a Standby phase-ban lehet aktiválni.Ezek után jön a Main phase 1.Ebben a periódusban nézhetjük meg a kártyáinkat,rakhatjuk ki egy szörnyet támadó vagy védelmi állásba(megváltoztathatjuk az állását a lent lévő szörnyeknek,felfordíthatjuk őket) vagy készenlétbe helyezhetjük varázs-és csapdakártyáinkat.Az első körben nem lehet támadni,ezért nincs még Battle phase,rögtön az End phase jön.Miután az ellenfél is befejezte a körét,ismét mi jövünk.Kezdődik minden előről,de már támadhatunk is.Minden esetben egy támadó -egy támadotatt rendszerben megy a dolog,kivéve,ha nincs fent az ellenfelünk lénye,mert akkor közvetlenül az életpontjait támadhatjuk.Nem törvényszerű dolog a támadás,innen lehet választani:vagy befejezzük a kört,vagy visszatérünk a Main phase 2-be,ha valamit elfelejtettünk megcsinálni.

A pontozás következőképpen működik:

Ha egy szörny védekező állásban van a támadó szörny attack pontjának magasabbnak kell lennie(ekkor a védő szörny megsemmisűl),ha egyenlő,mindkettő elpusztúl,ha kisebb akkor pedig annyi pontot veszít a támadó fél,ahány pont a különbség a szörnyének attack és az ellenfél defense pontjai között.Pl.:Mistycal Elf defense pontja 2000,ha megtámadóm egy 1500 támadó puntú szörnyel akkor én vesztek 500 pontot.Ha nincs már az ellenfélnek semmi a pályáján(de nekünk van),akkor támadhatjuk az ellenfél életpontjait diret módon is.Ha támadóállásba lévő szörnyet támadunk és nagyobb a mi támadópontunk,akkor a "felesleges" pontok az ellenfél életpontjait csökkentik.

Ezután eldönthetjük,hogy befejezzük a kört vagy rátérünk a Main phase 2-re.Itt már csak esetleg varázs-és csapda kártyákat rakhatunk fel,vagy a Main phase 1-ben nem summonáltunk szörnyet,még most is megtehetjük.